中共巴中市委党校校长（四川大巴山干部学院院长）由市委常委、组织部部长兼任，巴中市行政学院院长由市委常委、常务副市长兼任，巴中市社会主义学院院长由市委常委、统战部长兼任。

常务副校（院）长主持校（院）全面工作。

校内领导职数6名（常务副校（院）长1名、副校（院）长4名、机关党委书记1名）。

内设职能科室6个：办公室、教务科（培训科）、科研科（信息技术科）、组织人事科、财务科、对外交流合作科。

教学研究机构8个：党建教研室（马克思主义理论研究室）、党史教研室、哲学和法学教研室、经济学教研室（乡村振兴研究室）、党性教育研究中心（川陕苏区历史研究中心）、管理学教研室、社会和文化教研室、信息化教研室（教学实训中心）。